公司还未申请vat，亚马逊代收20%税费后，我们后期申请vat下来后，还需要向英国政府补缴之前的vat税费么？

不用

要是不用的话，亚马逊收取的vat税就只是佣金的20%，但是英国政府收取的是产品价格的20%，这两个差距很大，为什么计算方法会不一样？

英国暂时没有要求补缴之前的销售税，是从注册时开始计算。

其实最好是要的,因为HMRC有不可抗力的权利要求平台提供您的销售数据,如果税局注意上您,发现您的销售时间是在你VAT注册之前,还是会让您补申报以及罚金的

举个例子：一般而言，如果商家在 2012年10月21日 取得VAT号码，第一个申报期则是 2012年10月21日-2012年11月30日 。
商家需要在 2012年12月1日-31日 之间，把 10月21日-11月30日 的交易如实申报，并且缴纳相应税款。